يقوم الفرع بتدريس الأحياء السنة الأولى و الجراثيم و الطفيليات و المناعة و الفيروسات السنة الثانية , كما و يقوم الفرع بالتدريس والإشراف على طلبة الدراسات العليا للحصول على شهادة الماجستير في اختصاص الأحياء المجهرية البيطرية و الطفيليات البيطرية و شهادة الدكتوراه في اختصاصي الأحياء المجهرية البيطرية و الطفيليات البيطرية .

ان الجامعة التي تنبع من هذا العمق والامتداد التاريخي لابد ان تكون متميزة وتؤسس لابداع علمي وحضاري أنها - جامعة ديالى - التي ألقى اسمها على عاتقها مسؤولية كبيرة فمن جهة كان لابد لها أن تستوعب امتدادها التاريخي بما يحافظ على تراثها الزاخر بكل ما هو إبداعي ومن جهة أخرى عليها أن تواكب التطورات  التي حدثت للعالم وحولته الى قرية صغيرة